Wnętrza, w których są trzymane leki cytostatyczne, mają spełniać wymogi w zakresie bezpieczeństwa i higieny pracy zawarte w odrębnych przepisach dla zakładów opieki zdrowotnej. Apteka ma posiadać meble apteczne pozwalające ne wytwarzanie produktów w postaciach farmaceutycznych wykonywanych w aptekach a także wyposażenie aptek pozwalające na prawidłowe przechowywanie produktów leczniczych i wyrobów medycznych w sposób zabezpieczający je przed zakurzeniem i zabrudzeniem. Do apteki ogólnodostępnej muszą prowadzić co najmniej dwa odrębne wejścia, jedno dla osób korzystających z usług apteki oraz dla pracowników i przyjęć towaru. Do apteki szpitalnej muszą prowadzić co najmniej dwa odrębne wejścia, jedno dla pracowników szpitala, drugie dla dostaw towaru. Wejście dla osób korzystających z usług apteki ogólnodostępnej musi zapewniać nieograniczony dostęp do izby ekspedycyjnej w czasie godzin pracy apteki, w tym także dla osób niepełnosprawnych, oraz możliwość sprzedaży produktów leczniczych i wyrobów medycznych w porze nocnej.
Projektowanie aptek nie jest tak prostą sprawą jak mogło by się zdawać na pierwszy rzut oka. Przyczyną tego jest chociażby fakt, że duże obostrzenia określa rozporządzenie ministra zdrowia. Czytamy w nim, że apteka ogólnodostępna posiada specjalne meble apteczne oraz ma być usytuowana na parterze, a pomieszczenia ekspedycyjne apteki ogólnodostępnej nie mogą być pomieszczeniami przechodnimi i bezwzględnie mają być umiejscowione na pierwszej kondygnacji nadziemnej budynku, pod warunkiem że poziom podłogi tego pomieszczenia jest na wysokości lub powyżej poziomu urządzonej okolicy budynku. Przy okazji dopuszcza się zlokalizowanie pozostałych wnętrz apteki na pozostałych piętrach, przy zachowaniu zasady, iż lokal apteki stanowić będzie organizacyjnie i funkcjonalnie wydzieloną całość, tak aby wszystkie pomieszczenia wchodzące w skład apteki udostepni się bez przymusu wychodzenia na zewnątrz.
Wymagane meble do apteki ogólnodostępnej stanowią stół ekspedycyjny, który może być zasłonięty w sposób uniemożliwiający dostęp do niego ludziom niezatrudnionym w aptece, z zamontowanymi szufladami do składowania wyodrębnionych asortymentowo materiałów leczniczych i leków, szafy ekspedycyjne zamykane do wysokości przynajmniej 60 cm od podłogi, szafy magazynowe zamykane lub regały oraz łatwe do czyszczenia podesty, szafy lub kasety z przeznaczeniem do przechowywania środków odurzających i substancji psychotropowych zabezpieczone według odrębnych przepisów. Często spotykane meble apteczne to także lodówka lub szafa chłodnicza z termometrem, przeznaczona tylko do trzymania medykamentów, termometry i higrometry w każdym pomieszczeniu, w którym trzyma się lub sporządza produkty lecznicze oraz przechowuje się wyroby medyczne, loża recepturowa kryta tworzywem łatwym do czyszczenia, odpornym na chemikalia, wagi wielozakresowe, których parametry określają odrębne przepisy, stół kryty tworzywem łatwym do czyszczenia, odpornym na chemikalia, aparat do otrzymywania wody oczyszczonej z właściwie zabezpieczonym odbieralnikiem. Jeżeli apteka wytwarza wodę oczyszczoną, szkło do przygotowywania leków recepturowych, naczynia i utensylia recepturowe, właściwie oznakowane, do wytwarzania leków recepturowych, z wydzieleniem naczyń i utensyliów dla środków z grupy bardzo mocno działających.
Wymagane meble do aptek szpitalnych i ogólnodostępnych stanowią stół ekspedycyjny, loża do wytwarzania leków w warunkach aseptycznych, stół laboratoryjny, digestorium, autoklaw, sterylizator, aparatura do rozpuszczania, sączenia i rozlewania kropli ocznych oraz do sporządzania pozostałych leków jałowych. Jeżeli w aptece szpitalnej są wytwarzane produkty do odżywiania pozajelitowego i dojelitowego, leki cytostatyczne, koncentraty do hemodializy i dializy dootrzewnowej lub ciecze infuzyjne, inne konieczne meble apteczne to aparatura służąca do sporządzania leków do żywienia pozajelitowego, sporządzania leków do żywienia dojelitowego, wytwarzania medykamentów cytostatycznych, przygotowywania roztworów do hemodializy i dializy dootrzewnowej, przygotowywania cieczy infuzyjnych. Jeżeli apteka wytwarza leki w warunkach jałowych, to wymagane jej wyposażenie stanowią ponadto, loża z nawiewem laminarnym do przygotowywania medykamentów w warunkach jałowych, usytułowana w oddzielnym pomieszczeniu lub izbie recepturowej, sterylizator. Aptekę, w której są wytwarzane produkty homeopatyczne, wyposaża się ponadto w aparaturę umożliwiającą wytwarzanie tych produktów w określonych postaciach farmakopealnych.